Хотя клуб Пройссен Мюнстер является одним из старейших немецких футбольных клубов, его история немного грустна. Будучи клубом основателем Бундеслиги, он вылетел из неё после первого же её сезона и более никогда обратно не возвращался.
Интересный факт — с самого своего основания, клуб Пройссен Мюнстер не менял своего названия. Он был основан 30 апреля 1906 года, студентами реального училища Йохана Конрада Шлауна в Мюнстере. Клуб получил название Пройссен (Preussen) — Пруссия. Дав клубу такое название, его члены хотели продемонстрировать свои вероподданические чувства.
По началу клуб не имел своего стадиона и матчи игрались на армейском плацу в Лодденхайде. В то время в Мюнстере был расквартирован VII корпус Германской армии под командованием генерал-лейтенанта Морица фон Биссинга. Именно он дал разрешение игрокам Пройссена использовать плац для матчей, при непременном условии убирать за собой ворота.

Матч Пройссен Мюнстер — Арминия Билефельд состоявшийся 1 ноября 1925 года, был первым футбольным матчем в истории немецкого футбола транслировавшимся по радио. Матч комментировал спортжурналист «Вестдойче Функштунде» Бернард Эрнст.
Он был первым немецким футбольным радиокомментатором. Эрнст комментировал матч сидя за футбольными воротами, а его аппаратуру закрепили в хоккейных воротах, во избежание попадания мячей. Матч выиграла билефельдская Арминия со счётом 0:5.
Трансляция матча по радио привела к резкому повышению спроса на радиоприёмники, количество которых в Германии к концу 1926 г., достигло цифры 780,000.
24 июня 1907 года Пройссен Мюнстер сыграл свой первый официальный матч против Оснабрюка и выиграл его со счётом 5:0. После этого клуб подал заявку на участие в турнире Западногерманской лиги и 8 августа 1907 года был включён во второй её дивизион. Однако уже в 1908 году, «мюнстерские орлы» поднялись в первый дивизион, а в 1914 году выиграли Земельный чемпионат Вестфалии.
С 1916 по 1926 года Пройссен Мюнстер играл на Мюнстерманнплац, что недалеко от современного Пройссенштадиона. В 1926 году клуб вселился на Пройссенштадион на Хаммер Штрассе и с тех пор постоянно играет на этой арене.
В 1921 году, Пройссен трансформировался из футбольного клуба (FC Preussmünster) в спортивный клуб (SC Preussmünster). Причиной этому было то, что под эгидой клуба возникли секции тенниса и лёгкой атлетики.
В 1933 году Пройссен пробился в Гаулигу Вестфалия, но играл в ней плохо, дважды вылетая из неё. Вылетев из первого дивизиона в 1941 году, клуб так более и не поднимался в верхний дивизион.
Послевоенная эпоха.
После войны, мюнстерские орлы играли в Ландеслиге Вестфалия и в 1948 году пробились в Оберлигу Вест. В сезоне 1950/51 название клуба выстрелило по всей Германии! Причиной стали не спортивные успехи клуба, а его... деньги.
В то время, у клуба появился эдакий попечительский совет, который помогал клубу материально. Это был прообраз сегодняшних спонсоров. На деньги спонсоров клуб купил ряд хороших игроков:
- правый вингер Феликс Герритцен из ФК Ольденбург
- нападающий Альфред Прайслер из Боруссии Дортмунд
- полузащитник Руди Шульц
- левый вингер Йозеф Ламмерс
- полузащитник Зигфрид Рахуба
В 1952 году к ним был докуплен Вернер Эрб. Всё это было в диковинку для немецкого футбола, где прежде игроки играли не за деньги, а за клуб. Переходы игроков из клуба в клуб, существовали только по причине переезда игрока в другой город. Таким образом, Пройссен Мюнстер стал первым немецким клубом, попытавшимся встать на профессиональные рельсы.
Бизнес активность мюнстерцев привелекла огромное внимание прессы. Газетчики во всю трубили о новом веянии в футболе и прозвали Пройссен Мюнстер — «атакой ценой в 100,000 дойчмарок». Однако разговоры о баснословных гонорарах в Пройссене были не совсем верны. Феликс Герритцен вспоминал, что после тренировок они получали бутылку молока и сосиску с картофельным салатом. Труд игроков оплачивался за каждый сыграный матч.
Успехи «атаки ценой в 100.000 дойчмарок».

Зигфрид Рахуба играл за Пройссен Мюнстер с 1949 по 1959 гг. За 238 игр в Оберлиге он забил 97 голов — лучший бомбардир клуба всех времён. При этом, 23 гола Рахуба забил в успешном для мюнстерцев сезоне 1950/51.
Все эти усиления состава конечно же принесли результат — в сезоне 1950/51 Оберлиги Вест, Пройссен занял второе место, уступив на одно очко Шальке. Заняв второе место, Пройссен Мюнстер попал в групповую стадию, где его соперниками были Нюрнберг, Гамбург и Теннис Боруссия Берлин. Матч с Нюрнбергом поставил клубный рекорд посещаемости — 40,000 зрителей!
После победы мюнстерских орлов над клубом Теннис Боруссия в Берлине и выхода в финал чемпионата Германии, 23.000 горожан собрались на главной рыночной площади города, чтобы поприветствовать свою команду.
Однако финал чемпионата, который состоялся 30 июня 1951 года на Олимпиаштадионе в присутствии 100,000 человек, Пройссен проиграл. Два гола Отмара Вальтера принесли Кайзерслаутерну победу со счётом 1:2 и первое в истории немецкого футбола чемпионство «красных чертей».
После этого, Пройссен продолжал играть в Оберлиге, но уже числился в середняках. Лишь в сезоне 1953/54, клуб сумел занять 4 место.
В 1962 году Пройссен организовал поездку команды в Южную Америку, где клуб выиграл у национальных сборных Чили (3:0) и Аргентины (2:1). В мае 1963 года «мюнстерские орлы» играли в турнире International Soccer League в США — 3 победы/3 поражения/5 место.
Мюнстерские орлы и Бундеслига.
Клуб Пройссен Мюнстер был в числе клубов-основателей Бундеслиги в 1962 году. Пройссен Мюнстер вошёл в число 16 первых команд от Оберлиги Вест, вместе с дортмундской Боруссией, Шальке, Кёльном и Дуйсбургом.
24 августа 1963 года, на переполненном Пройссенштадионе состоялся первый матч Бундеслиги в Мюнстере, соперником «орлов» был Гамбург. На гол игрока Пройссена Фалько Дёрра, гамбургцы ответили голом Чарли Дёрфеля — 1:1.
Скатившись к концу первого круга на 15 место, Пройссен так и не сумел с него подняться. По итогам первого сезона Бундеслиги, мюнстерские орлы вылетели.

В 1966 году Пройссен отмечал своё 60-летие. По этому поводу, в Мюнстере была устроена товарищеская встреча с мюнхенской Баварией. Победу в матче со счётом 2:1 одержали именинники.
После этого, клуб вёл постоянную борьбу за выход в Первую бундеслигу. Играя сначала в Регионаллиге Вест, с сезона 1974/75 Пройссен стал играть в сформированной тогда Второй «Норд» Бундеслиге. В 1976, 1978 и 1979 годах Пройссен был близок к повышению в классе, но заканчивал сезон третьим.
В 1978 году клуб пережил финансовое потрясение — в бухгалтерии клуба были выявлены махинации с билетами и клубным бюджетом, которые привели к появлению задолженности в сумме 3 млн.дойчмарок. Президент клуба Гюнтер Веллердик и несколько членов правления были вынуждены уйти в отставку.
Пройссен Мюнстер в 1980, 1990 и 2000-х.

Кристоф Метцельдер — самый именитый воспитанник Пройссен Мюнстера. Чемпион Германии и Испании, обладатель Кубка и Суперкубка Германии, вице-чемпион Европы-2008, Метцельдер пользуется большой любовью в городе.
Скандал с клубными финансами привёл к ослаблению клуба в 80-х годах. Когда в 1981 году, DFB сформировал единую Вторую бундеслигу, то по итогам предыдущего сезона Пройссен в неё не попал и впервые опустился в третий дивизион. Только с приходом на тренерский мостик клуба Хельмута Хорша появилась надежда играть в Б2.
Если в 1988 году, Пройссен выиграв Оберлигу Вестфалия, не сумел пройти квалификационный раунд, то в 1989 году им улыбнулась удача — они поднялись! Сезон 1989/90 Пройссен проводил во Второй бундеслиге и закончил его на 12 месте. Кстати в том сезоне, мюнстерцы дважды обыграли Шальке.
В следующем сезоне 1990/91, мюнстерцы вылетели из Второй бундеслиги и началось шарахание по различным низшим и любительским лигам. В итоге дело дошло до того, что в сезоне 2005/06, «орлы» вылетели в четвёртую лигу. В год своего столетия клуб впервые спустился в четвёртый дивизион...
К столетию Пройссена в городе были проведены ряд мероприятий. 22 февраля 2006 года в городском музее была открыта экспозиция, посвященная столетию клуба, а 30 апреля клуб устроил большой праздничный приём. На него были приглашены официальные лица города, тренера и игроки клуба, ветераны Пройссена.
Только при тренере Марке Фашере, в 2010 году клуб сумел выиграть Регионаллигу Вест и пробиться в Третью лигу. С сезона 2011/2012, Пройссен Мюнстер играет в Третьей лиге.
Показатели клуба в 3 Лиге.
- 2011/12 - 12 место
- 2012/13 - 4 место
- 2013/14 - 6 место
- 2014/15 - 8 место
- 2015/16 - 9 место
В нынешнем сезоне игра команды весьма нестабильна, первую половину сезона мюнстерцы провалили. Лишь после зимней паузы игра команды немного выравнялась.